Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxa10P31310 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms