Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CebpbP28033 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CebpbP28033 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms