Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hoxd12P23812 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms