Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms