Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms