Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms