Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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