Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18532 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18532 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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