Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms