Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms