Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms