Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms