Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms