Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms