Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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