Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms