Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HbaP01942 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HbaP01942 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HbaP01942 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HbaP01942 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HbaP01942 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HbaP01942 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HbaP01942 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HbaP01942 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms