Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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