Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Foxd2O35392 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Foxd2O35392 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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