Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms