Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms