Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms