Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20795J3QP49 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms