Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r167G3UW71 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r167G3UW71 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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