Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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