Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Gm10378F6XQQ1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm10378F6XQQ1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm10378F6XQQ1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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