Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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