Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms