Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms