Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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