Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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