Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mterf1bB9EJ57 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mterf1bB9EJ57 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mterf1bB9EJ57 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mterf1bB9EJ57 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mterf1bB9EJ57 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms