Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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