Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms