Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms