Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AU015836B2RUM3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AU015836B2RUM3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms