Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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