Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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