Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms