Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Usp36B1AQJ2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Usp36B1AQJ2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms