Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms