Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms