Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lcn6A2AJB9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lcn6A2AJB9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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