Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms