Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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PtprfA2A8L5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprfA2A8L5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprfA2A8L5 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprfA2A8L5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms