Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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