Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn8Q9Z260 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn8Q9Z260 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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