Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms