Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms