Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms